Proteinmærke

Protein tags er peptidsekvenser genetisk podet på et rekombinant protein. Ofte er disse tags er fjernes ved kemiske midler eller ved enzymatiske midler, såsom proteolyse eller intein splejsning. Tags er bundet til proteiner til forskellige formål.

Affinitetsmærker er vedlagt til proteiner, således at de kan oprenses fra deres rå biologisk kilde ved hjælp af en affinitetsteknikken. Heriblandt chitin-bindende protein, maltosebindende protein og glutathion-S-transferase. Poly tag er et udbredt proteinmærke; det binder til metal matricer.

Solubilisering tags bruges, især for rekombinante proteiner udtrykt i chaperone-deficiente arter såsom E. coli, for at hjælpe med korrekt foldning i proteiner og holde dem fra at udfælde. Disse omfatter thioredoxin og poly. Nogle affinitetsmærker har en dobbelt rolle som solubiliseringsmiddel, såsom MBP, og GST.

Kromatografi tags bruges til at ændre kromatografiske egenskaber af proteinet til opnåelse anden opløsning over en bestemt separationsteknik. Ofte er disse består af polyanioniske aminosyrer, såsom FLAG-mærke.

Epitopmærker er korte peptidsekvenser, som er valgt, fordi højaffinitetsantistoffer pålideligt kan fremstilles i mange forskellige arter. Disse er normalt stammer fra virale gener, som forklarer deres høje immunoreaktivitet. Epitopmærker inkluderer V5-tag, Myc-tag, og HA-tag. Disse mærker er særligt anvendelige til Western blotting, immunfluorescens og immunpræcipitationseksperimenter, selv om de også finder anvendelse i antistofoprensning.

Fluorescens tags bruges til at give visuel udlæsning på et protein. GFP og dens varianter er de mest almindeligt anvendte fluorescens tags. Mere avancerede anvendelser af GFP omfatter brug det som en sammenfoldelig reporter.

Protein tags finde mange andre kutymer, såsom specifikke enzymatisk modifikation og kemisk modifikation tag. Ofte tags kombineres til at producere multifunktionelle modifikationer af proteinet. Dog med tilføjelse af hvert mærke kommer risikoen for, at det native proteinets funktion kan afskaffes eller kompromitteret af interaktioner med tagget. Derfor, efter rensning, tags er almindeligt fjernes ved specifik proteolyse

Liste over proteinmærker

Peptidmærker

  • AviTag, et peptid tillader biotinylering af enzymet BirA og så proteinet kan isoleres ved streptavidin
  • Calmodulin-tag, et peptid er bundet af protein calmodulin
  • polyglutamat tag, et peptid binding effektivt på anionbytterharpiks såsom Mono-Q
  • E-tag, et peptid genkendes af et antistof
  • FLAG-mærke, et peptid genkendes af et antistof
  • HA-tag, et peptid genkendes af et antistof
  • His-mærke, 5-10 histidiner bundet af en nikkel- eller Coboltchelat
  • Myc-tag, en kort peptid genkendes af et antistof
  • S-tag
  • SBP-tag, et peptid, der binder til streptavidin
  • Softag 1, for pattedyrekspression
  • Softag 3, for prokaryot ekspression
  • Strep-tag, et peptid, der binder til streptavidin eller den modificerede streptavidin kaldes streptactin
  • TC-tag, et tetracysteine ​​tag, der er anerkendt af Flash og ReAsH biarsenical forbindelser
  • V5 tag, et peptid genkendes af et antistof
  • VSV-tag, et peptid genkendes af et antistof
  • Xpress tag

Kovalente peptidmærker

  • Isopeptag, et peptid, der binder kovalent til pilin-C-protein
  • SpyTag, et peptid, der binder kovalent til SpyCatcher protein

Proteinmærker

  • BCCP, et protein domæne biotinyleret af BirA muliggør anerkendelse streptavidin
  • Glutathion-S-transferase-tag, et protein, som binder til immobiliseret glutathion
  • Grønt fluorescerende protein-tag, et protein, der er spontant fluorescerende og kan være bundet af nanobodies
  • Maltosebindende protein-tag, et protein, der binder til amylose agarose
  • Nus-tag
  • Thioredoxin-tag
  • Fc-tag, der stammer fra immunglobulin-Fc-domæne, tillade dimerisering og solubilisering. Kan anvendes til oprensning på protein-A-sepharose
  • Oprettet Intrinsically Disordered tags indeholder lidelse fremme aminosyrer

Andre

  • Ty-tag

Applikationer

  • Affinitetsoprensning
  • Proteinarray
  • Western blotting
  0   0
Forrige artikel Demon FM
Næste artikel Etisk intuitionisme

Relaterede Artikler

Kommentarer - 0

Ingen kommentar

Tilføj en kommentar

smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile
Tegn tilbage: 3000
captcha