Peptidsekvens

Peptidsekvens eller aminosyresekvens, er den rækkefølge, hvori aminosyrerester, der er forbundet med peptidbindinger, ligger i kæden i peptider og proteiner. Sekvensen er generelt rapporteret fra N-terminale ende indeholder frie aminogruppe til C-terminale ende som indeholder fri carboxylgruppe. Peptidsekvens kaldes ofte protein sekvens, hvis den repræsenterer den primære struktur af et protein.

Sekvens notation og applikationer

Mange peptidsekvenser er blevet tilføjet til sekvensdatabaser. Disse databaser kan bruge forskellige notationer til at beskrive peptidsekvensen. De fulde navne aminosyrer er sjældent givet; stedet, er 3-bogstavers eller 1-bogstavsforkortelser normalt registreret for kortfattethed.

Flere fradrag kan foretages fra selve sekvensen. Lange strækninger af hydrofobe rester kan indikere transmembranspiraler. Disse spiraler kan indikere peptidet er en celle receptor. Visse rester angiver en beta arkområde. Hvis fuld-længde proteinsekvensen rådighed, er det muligt at estimere det isoelektriske punkt for proteinet. Metoder til bestemmelse peptidsekvensen omfatter fradrag i DNA-sekvensen, Edman-nedbrydning, og massespektrometri.

Teknikker i sekvensanalyse kan anvendes til at lære mere om peptidet. Disse teknikker består generelt af at sammenligne sekvensen med andre sekvenser fra sekvensdatabaser. Andre sekvenser kan allerede blevet undersøgt og bestemt til at være betydelig. Resultater om disse sekvenser kan være gældende til den sekvens, der undersøges.

  0   0

Kommentarer - 0

Ingen kommentar

Tilføj en kommentar

smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile
Tegn tilbage: 3000
captcha