Entrez

FONT SIZE:
fontsize_dec
fontsize_inc
Juli 4, 2016 Gerd Bendz E 0 0

Den Entrez Global Query Cross-Database Søg System er en kraftfuld fødereret søgemaskine, eller web-portal, der giver brugerne mulighed for at søge mange diskrete databaser sundhedsmæssige Fakultet ved National Center for Biotechnology Information hjemmeside. NCBI er en del af National Library of Medicine, som selv er en afdeling af National Institutes of Health, som igen er en del af United States Department of Health and Human Services. Navnet "Entrez" blev valgt til at afspejle ånden i byde offentligheden til at søge i indholdet tilgængeligt fra NLM.

Entrez Global Query er en integreret søgning og genfinding system, der giver adgang til alle databaser samtidigt med en enkelt forespørgselsstreng og brugergrænseflade. Entrez effektivt kan hente beslægtede sekvenser, strukturer og referencer. Det Entrez systemet kan give udsigt til gen- og protein sekvenser og kromosom kort. Nogle lærebøger er også tilgængelige online via Entrez systemet.

Egenskaber

Den Entrez forsiden giver som standard adgang til det globale forespørgsel. Alle databaser indekseret af Entrez kan søges via en enkelt forespørgselsstreng, støtte booleske operatører og søgeterm tags til at begrænse dele af søgningen erklæring til bestemte områder. Dette returnerer en samlet resultatside, der viser antallet af hits for søgningen i hver af de databaser, der er også links til faktiske søgeresultater for den pågældende database.

Entrez giver også en lignende interface til at søge hver enkelt database og til raffinering søgeresultater. Den Grænser funktion giver brugeren mulighed for at indsnævre en søgning en webformularer grænseflade. Historien funktion giver en nummereret liste over nyligt udførte forespørgsler. Resultaterne af tidligere forespørgsler kan angives med nummer og kombineret via booleske operatører. Søgeresultater kan gemmes midlertidigt i en Udklipsholder. Brugere med en MyNCBI konto kan spare forespørgsler på ubestemt tid, og også vælge at få opdateringer med nye søgeresultater e-mailet til gemte forespørgsler på de fleste databaser. Det er almindeligt anvendt inden for bioteknologi som et referenceværktøj for studerende og fagfolk ens.

Databaser

Entrez søger følgende databaser:

  • PubMed: biomedicinsk litteratur citater og abstracts, herunder Medline - artikler fra tidsskrifter, ofte herunder abstracts. Link til PubMed Central og andre ressourcer i fuld tekst leveres til artikler fra 1990'erne.
  • PubMed Central: gratis, fuld tekst tidsskriftsartikler
  • Site Search: NCBI web og FTP hjemmesider
  • Bøger: online bøger
  • Online Mendelsk Arv i Man
  • Online Mendelsk Arv i Dyr
  • Nukleotid: sekvensdatabase
  • Protein: sekvensdatabase
  • Genom: Hele genomsekvenser og kortlægning
  • Struktur: tredimensionale makromolekylære strukturer,
  • Taksonomi: organismer i GenBank Taksonomi
  • SNP: single nukleotid polymorfisme
  • Gene: gen-centrerede oplysninger
  • HomoloGene: eukaryote homologigrupperne
  • Pubchem Compound: unikke lille molekyle kemiske strukturer
  • Pubchem Stof: aflejret kemiske stof optegnelser
  • Genome Project: genomprojekt information
  • UniGene: gen-orienterede klynger af udskrift sekvenser
  • CDD: konserveret protein domænedatabase
  • UniSTS: markører og kortdata
  • PopSet: befolkningsundersøgelse datasæt
  • GEO Profiler: udtryk og molekylær overflod profiler
  • GEO datasæt: eksperimentelle sæt GEO data
  • Sekvens læses arkiv: high-throughput sekventering data
  • Kræft Kromosomer: cytogenetiske databaser
  • Pubchem Bioassay: bioaktivitet skærme af kemiske stoffer
  • GENSAT: genekspression atlas af muse centralnervesystemet
  • Probe: sekvensspecifikke reagenser
  • NLM Catalog: NLM bibliografiske data for mere end 1,2 millioner tidsskrifter, bøger, audiovisuelle, computersoftware, elektroniske ressourcer, og andre materialer med bopæl i LocatorPlus.

Adgang

Ud over at bruge søgemaskinen formularer til at forespørge data i Entrez, NCBI giver Entrez Programmering Utilities for mere direkte adgang til at forespørge resultater. De eUtils er adgang ved at udgive særligt dannede URL'er til NCBI server og parsing XML respons. Der er også en eUtils SOAP interface.

Historie

I 1991 blev Entrez indført i CD-form. I 1993 en klient-server-version af den software, tilslutningsmuligheder med internettet. I 1994 NCBI etableret en hjemmeside, og Entrez var en del af denne første udgivelse. I 2001 blev Entrez boghylde frigivet og i 2003 blev Entrez Gene databasen udvikles.

  0   0
Forrige artikel Relationer Armenien og Iran
Næste artikel CSAV

Kommentarer - 0

Ingen kommentar

Tilføj en kommentar

smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile
Tegn tilbage: 3000
captcha