Amidasen

In Enzymology, en amidase, amidohydrolase, deaminase, fede acylamidase, N-acetylaminohydrolase) er et enzym, der katalyserer hydrolysen af ​​et amid:


Således er de to substrater for dette enzym er monocarboxylsyre amid og H2O, mens de to produkter er monocarboxylat og NH3.

Dette enzym tilhører familien af ​​hydrolaser, der handler på carbon-nitrogen bortset peptidbindinger obligationer, specielt i lineære amider. Det systematiske navn for dette enzym klasse er acylamid- amidohydrolase. Andre navne i almindelig brug omfatter acylamidase, acylase, amidohydrolase, deaminase, fede acylamidase, og N-acetylaminohydrolase. Dette enzym deltager i 6 metaboliske veje: urinstofcyklussen og metabolisme af aminogrupper, phenylalanin, tryptophan metabolisme metabolisme, cyanoamino acid metabolisme, benzoat nedbrydning via CoA ligering, og styren nedbrydning.

Amidaser indeholder et konserveret strækning af ca. 130 aminosyrer kendt som AS-sekvensen. De er udbredt, blev fundet i både prokaryoter og eukaryoter. AS enzymer katalyserer hydrolysen af ​​amidbindinger, selvom familien er afveget bredt med hensyn til substratspecificitet og funktion. Ikke desto mindre, disse enzymer opretholde en kerne alpha / beta / alpha struktur, hvor topologier af N- og C-terminale halvdele er ens. Enzymer har karakteristisk et yderst konserveret C-terminale region rig på serin og glycinrester, men blottet for asparaginsyre og histidinrester derfor de adskiller sig fra klassiske serin hydrolaser. Disse enzymer besidder en unik, højkonserveret Ser-Ser-Lys katalytiske triade anvendes til amidhydrolyse, selvom den katalytiske mekanisme for acyl-enzym-mellemproduktdannelse kan variere mellem enzymer.

Eksempler på AS signatur-holdige enzymer indbefatter:

  • Peptidamidase, som katalyserer hydrolyse af C-terminale amidbinding af peptider.
  • Fedtsyreamid hydrolaser, der hydrolyseres fedtsyre midt substrater, og derved styre omfanget og varigheden af ​​signalering fremkaldt af denne forskelligartede klasse af lipid-sendere.
  • Malonamidase E2, som katalyserer hydrolysen af ​​malonamate i malonat og ammoniak, og som er involveret i transport af faste kvælstof fra bacteroids at plante celler i symbiotisk kvælstof stofskifte.
  • Underenhed A af Glu-tRNA amidotransferase, en heterotrimerisk enzym, der katalyserer dannelsen af ​​Gln-tRNA ved transamidering af misacylated Glu-tRNA via amidolyse af glutamin.

Strukturelle undersøgelser

Som i slutningen af ​​2007, har to strukturer blevet løst for denne klasse af enzymer, med FBF tiltrædelsen koder 2PLQ og 2UXY.

  0   0
Forrige artikel A. J. M. Smith

Kommentarer - 0

Ingen kommentar

Tilføj en kommentar

smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile
Tegn tilbage: 3000
captcha