Alphaproteobacteria

FONT SIZE:
fontsize_dec
fontsize_inc
Februar 9, 2016 Elsba Faye A 0 0

Alphaproteobacteria er en klasse af bakterier i phylum Proteobacteria. Dens medlemmer er meget forskellige og har nogle fællestræk, men ikke desto mindre deler en fælles forfader. Som de fleste medlemmer af Proteobacteria, de fleste af dens medlemmer er Gram-negative og nogle af dens intracellulære parasitiske medlemmer mangler peptidoglycan og er derfor gram variabel.

Egenskaber

Den Alphaproteobacteria er en mangfoldig orden og omfatter flere fototrofe slægter, flere slægter metaboliserende C1-forbindelser, symbionter af planter, endosymbionts af arthropoder og intracellulære patogener. Desuden klassen omfatter protomitochondrion, bakterien, der blev opslugt af den eukaryote forfader og gav anledning til mitokondrierne, som er organeller i eukaryote celler. En art af teknologisk interesse er Rhizobium radiobacter: forskerne bruger ofte denne art til at overføre fremmed DNA i plante genomer. Aerobic anoxygenic fototrofe bakterier, såsom Pelagibacter ubique, er alphaproteobacteria der er et vidt udbredt marine plankton, der kan udgøre over 10% af det åbne hav mikrobielle samfund.

Evolution og genomik

Der er en vis uenighed om fylogeni af ordrerne, især for placering af Pelagibacterales, men generelt er der nogle konsensus. Dette problem skyldes dannelse af store forskel i genet indhold og den store forskel i GC-rigdom mellem medlemmer af flere orden. Konkret Pelagibacterales, Rickettsiales og Holosporales indeholder arter med AT-rige genomer. Det er blevet fremført, at det kunne være et tilfælde af konvergent evolution, der ville resultere i en kulturgenstandsspor klyngedannelse. Men flere undersøgelser uenige ,. Endvidere har det vist sig, at GC-indholdet af ribosomalt RNA, den traditionelle fylogenetiske markering, lidt afspejler GC-indholdet af genomet: for eksempel medlemmer af Holosporales har en meget højere ribosomal GC-indhold end medlemmer af Pelagibacterales og Rickettsiales, som har tilsvarende lave genomisk GC-indhold, fordi de er mere nært beslægtet med arter med høje genomiske GC-indhold end til medlemmer af de to sidstnævnte ordrer

The Class Alphaproteobacteria er opdelt i tre underklasser Magnetococcidae, Rickettsidae og Caulobacteridae. Den basale gruppe er Magnetococcidae, som er sammensat af en stor mangfoldighed af magnetotactic bakterier, men kun én er beskrevet, Magnetococcus marinus. Den Rickettsidae er sammensat af de intracellulære Rickettsiales og fritlevende Pelagibacterales. Den Caulobacteridae består af Holosporales, Rhodospirillales, Sphingomonadales, Rhodobacterales, Caulobacterales, Kiloniellales, Kordiimonadales, Parvularculales og Sneathiellales.

Sammenlignende analyser af de sekventerede genomer har også ført til opdagelsen af ​​mange bevarede indels i udbredte proteiner og hele proteiner, der er karakteristiske kendetegn for enten alle Alphaproteobacteria eller deres forskellige vigtigste ordrer og familier. Disse molekylære signaturer tilvejebringe nye midler til circumscription af disse taksonomiske grupper og til identifikation / tildeling af nye arter i disse grupper. Fylogenetiske analyser og bevarede indels i stort antal andre proteiner godtgøre, at Alphaproteobacteria har forgrenet sig senere end de fleste andre phyla og Klasser af bakterier med undtagelse Betaproteobacteria og Gammaproteobacteria.

Fylogeni

Den aktuelt accepterede taksonomi er baseret på listen over Prokaryote navne med stående i nomenklatur og National Center for Biotechnology Information og fylogeni er baseret på 16S rRNA-baserede LTP frigive 106 af 'The All-Arter Living Tree' Projekt

Bemærkninger:
♠ Stammer findes på National Center for Biotechnology Information, men ikke er opført på listen over Prokaryote navne med stående i nomenklatur

  0   0
Forrige artikel Bekendtgørelse 6102
Næste artikel Baikal Rift Zone

Kommentarer - 0

Ingen kommentar

Tilføj en kommentar

smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile
Tegn tilbage: 3000
captcha